Użytkownicy MorphOS-a, którzy używają na Pegasosie również systemu Linux (a zwłaszcza kernela nowszego niż 2.6.9) po powrocie z Linuksa do MorphOS-a mogli zapewne zauważyć problemy z połączeniem z siecią przy wykorzystaniu wbudowanej karty sieciowej VIA Rhine. Jednym z rozwiązań jest uruchomienie Linuksa z kernelem 2.6.9 lub starszym, innym całkowite odłączenie Pegasosa od prądu i ponowne uruchomienie komputera. O rozwiązanie problemu nie zadbał jak na razie zespół pracujący nad systemem MorphOS a linuksowi programiści wspierający Pegasosa najprawdopodobniej również nie są tym zainteresowani. Wszystko zostałoby po staremu, ale na szczęście napisano łatkę dla MorphOS-a, która rozwiązuje problem. Plik wykonywalny znajdujący się w tym archiwum należy skopiować do katalogu SYS:C partycji systemowej, a następnie dopisać do user-startup ścieżkę do tego pliku, by łatka uruchamiała się przed oprogramowaniem sieciowym.