Zdażyło mi się, że ToolsDaemon nie uruchamiał się przy starcie systemu. Wyświetlał okno z napisem: "Couldn't find workbench window". Pomogło wstawienie przed i po poleceniu LoadWB (w startup-sequence) komendy "Wait 2". Rozwiązanie to nadesłał mi Sajgon na forum PPA.