Dwa dni szukałem tego buga i okazało się, że powoduje go (akurat u mnie jest to bug) wykonanie metody MUIM_Dirlist_ReRead. W momencie kiedy tego zupełnie nie chciałem program zachowywał sie tak jakbym fizycznie kliknął na liście, czyli ustawiany był atrybut MUIA_List_Active.
Okazało się, że w/w metoda przy okazji odświerzenia listy ustawia tez ten atrybut. Z jednej strony logiczne, bo po odświerzeniu listy ustawia, że żaden element nie jest zaznaczony, ale z drugiej strony, jeśli ma się ustawione notyfikacje na ten właśnie atrybut i spodziewa się, że będzie on "łapany" tylko po fizycznych kliknięciach, to można być nieco zaskoczonym i sfrustrowanym :D
To tyle ku przestrodze przyszłych muiowych odkrywaczy.