Dla systemu AmigaOS 4.x pojawiła się nowa wersja AmiUpdate - narzędzia wykorzystywanego do uaktualniania oprogramowania. Wprowadzono dosyć dużo zmian. Na początek da się zauważyć narzędzie ustawień, którym można program wygodnie skonfigurować bez potrzeby "bawienia" się tooltypami. Ponadto program może zostać zikonifikowany do docka, nowa funkcja System RollBack, a także możliwość przeprowadzania uaktualnień bez konieczności posiadania dostępu do sieci (aktualizację można przeprowadzić z pliku znajdującego się na dysku lub płycie CD). Z uwagi na sporą liczbę ogólnych zmian i poszczególnych komponentów systemu, zaleca się pełną aktualizację nowej wersji w celu uniknięcia bliżej nieprzewidzianych zachowań.