Chris Handley przygotował dla AmigaOS 4.x nową wersję RunInUAE. Jest to aplikacja zaprojektowana z myślą o użytkownikach, którzy na nowym systemie nadal lubią bawić się amigowym dziedzictwem w postaci gier. Pozwala ona uruchamiać bezpośrednio z poziomu Workbencha zarówno gry zainstalowane metodą tradycyjną, przez WHDLoad oraz bezpośrednio z plików ADF. Do pracy programu wykorzystywany jest emulator E-UAE (w tym także wersja AMIGFX wydana 30 lipca 2011). Wersja r6 wchodzi w skład czwartego uaktualnienia systemu AmigaOS 4.1 i oferuje m. in. poprawę kompatybilności emulacji CD32 i CDTV, obsługę pamięci Non-Volatile (w przypadku emulacji CD32), wykorzystanie systemu notyfikacji Ringhio, poprawę obsługi plików ROM z pakietu Amiga Forever, poprawę niedziałających trybów graficznych. Więcej szczegółów można znaleźć w dokumentacji oraz w archiwum.