MorphUAE to przeznaczona dla systemu MorphOS odmiana emulatora E-UAE, która wykorzystuje interfejs MUI oraz wprowadza kilka zmian i usprawnień w stosunku do oryginału. Główne okno programu posiada pasek z ikonkami oraz "diody" przedstawiający status napędów dysków oraz pozwalające na podłączanie obrazów ADF. Dodatkowo program pozwala na tworzenie zrzutów ekranu, przełączenie w locie obsługi pomiędzy myszką a joystickiem, wykorzystanie pliku Kickstart ROM z AROS-a. Autorem programu jest Stefan Blixth. Więcej informacji, w tym zapowiedź zmian planowanych do w wersji 1.1, można znaleźć na GitHub.